Drie van de auteurs van de studie zijn verbonden aan het Statens Serum Institut (SSI) in Denemarken, een overheidsbedrijf dat verschillende vaccins met aluminium ontwikkelt. Het SSI koopt en levert ook vaccins voor het Deense nationale vaccinatieprogramma, wat een duidelijk institutioneel belangenconflict oplevert gezien de rol die het speelt in de productie en het gebruik van vaccins. Twee van de drie auteurs verklaarden echter geen belangenconflict. Hoofdauteur Anders Hviid gaf aan dat hij financiering ontving van onder andere de Novo Nordisk Foundation, die direct verbonden is aan farmaceutisch gigant Novo Nordisk en een aanzienlijke investeringspositie in de sector heeft. Dergelijke banden trekken de onafhankelijkheid van de studie in twijfel en onderstrepen de noodzaak om de internationale normen voor referentiewetenschap te versterken, zoals uiteengezet in het recente uitvoeringsbesluit van de regering-Trump waarin transparantie, reproduceerbaarheid en het delen van gegevens worden geëist. Deze normen zullen bepalen met wie de Verenigde Staten in de toekomst samenwerken of zaken doen.
In werkelijkheid biedt dit onderzoek allesbehalve transparantie. Zo toont geen enkele tabel hoeveel kinderen in elke aan aluminium blootgestelde cohort de betreffende aandoening hebben gekregen. Daardoor is het onmogelijk om de uitgevoerde berekeningen onafhankelijk te evalueren, waardoor lezers gedwongen worden te vertrouwen op de ondoorzichtige modelleringskeuzes van de auteurs, ten koste van wetenschappelijke reproduceerbaarheid.
